Музей истории основания Самарканда - Афрасиаб посвящен истории города Самарканда и его окрестностей. Здание музея расположено в северо-восточной части города, возле древнего городища Афрасиаб, который является одним из крупнейших археологических памятников в мире.

Музей рассказывает об истории основания города Самарканда, о его дальнейшей истории, рассказывает о городище Афрасиаб. В музее представлены различные экспонаты, в том числе найденные артефакты в ходе раскопок на территории Афрасиаба, Самарканда и их окрестностей. Среди них, остатки древних клинков, оссуарии, ножей и других режущих предметов, стрел, монет, керамики, древние рукописи и книги, статуэтки и другие древние повседневные предметы. Одним из примечательных экспонатов является уникальные сохранившиеся фрески самаркандского дворца, принадлежащего династии Ихшидов (VII-VIII века). В музее часть экспонатов связана с доисламской эпохой, частично связано с местным вариантом зороастризма, который был основной религией в Согде до прихода ислама.