В 40 км от Самарканда в горах близ селения Аксай, имеется место поклонение называемое Хазрат Довуд. Легендарный иудейский царь Давид почитается в Исламе как пророк. Народ сложил о нём немало легенд, где он упоминается как огромного роста благородный богатырь неимоверной силы. По одной из легенд, он скрываясь от врагов, достиг этих мест, но окружённый со всех сторон решил помолиться и встал на колени. Молитва была услышана богом и Хазрат Довуд был наделён нечеловеческой силой. Он раздвинул руками скалу и скрылся в образовавшейся пещере. Именно эта пещера ставшая объектом паломничества привлекает верующих. У входа в неё можно увидеть следы гигантских колен, а на её стенах опечатки огромных пальцев. Так считают верующие. Но для того чтобы подняться к пещере нужно пройти более 1300 ступеней вверх по склону горы, посетив небольшую мечеть на вершине по противоположному склону спуститься на 200 ступенек вниз. Только тогда можно очутиться перед пещерой Хазрат Довуда.

Значительным памятником гражданского типа является Тим (купольный пассаж) Чорсу, построенный в 90-ые годы ХVIII века у северо-восточного угла медресе Шердор ансамбля Регистан. Чорсу в плане представляет собой шестигранное здание, в центре с высоким куполом, расходящимся от него радиусом шестью коридорами проходами, по числу городских ворот Самарканда - Бухарских, Кяризгах, Сузангаранских, Фирузы, Аханин и Хайрабад. При Тимуре шесть основных магистральных улиц Самарканда, начинавшиеся от них, пересекались в Чорсу. Тим служил центральным рынком по продаже головных уборов, поэтому иногда назывался «тими тельпак фурушон». Ныне здесь располагается картинная галерея.

По легендарным сведениям XVIII века, в мавзолее захоронен прах ветхозаветного библейского пророка Данияра (Даниила), останки которого были привезены в Самарканд и захоронены среднеазиатским средневековым полководцем и завоевателем Амиром Тимуром (Тамерланом). Нынешнее здание мавзолея и комплекс были построены в самом начале XX века, в последующие годы само здание мавзолея и комплекс несколько раз были реконструированы.

Мавзолей и комплекс Ходжа Дониёр расположены в северо-восточной части города Самарканд, в северо-восточной окраине древнего городища Афрасиаб, на небольшой возвышенности, вблизи берега небольшой реки Сиаб.

Согласно исторической книге «Самария» среднеазиатского историка Абу Тахирходжи Самарканди, пророк Дониёр (Данияр) являлся одним из сподвижников исламского арабского проповедника Кусама ибн Аббаса, который сыграл ключевую роль в насаждении ислама в Самарканде и его окрестностях. В христианстве пророк Даниил — один из так называемых «великих пророков», автор одной из ветхозаветных библейских книг — книги Даниила. В иудаизме Даниель также один из почитаемых пророков.

Мавзолей Ак-Сарай (Белый дворец). Строился с 1460-1470 гг. Мужская усыпальница последних темуридов располагается к юго-востоку от мавзолея Гур-Эмир. Композиционное ядро постройки-крестообразный зал, имеющий  назначение поминальной комнаты (зиаратхона), угловые кельи и трёхчастный зал. Внутри, на стенах, парусах и куполе, сохранились фрагменты орнаментальной живописи, выполненные в технике «кундаль» с обильным применением золота, панели украшены тончайшей кашинной мозаикой. Внизу располагается восьмигранный склеп стены который облицован мрамором.

Медресе построено рядом с могилой и мечетью Хожа Ахрара. В этом медресе всё традиционно, все следует канонам ХVII столетия. Обращает на себя внимание мозаичный михраб и панель из зелёных шашек с бордюром «ислими». На портале изображены тигроподобные львы по аналогии с медресе Шердор на Регистане. Поэтому в народе это здание называют также «Шердори берун»  т.е. «внеш ний Шердор». Эпиграфика медресе содержит имя заказчика «Надирбек Тагай» и дату постройки (1638 г). В стихотворной надписи над входом, указано имя ещё одного мастера Ходжа Хашима.

В 2000 году по инициативе Первого Президента Республики Узбекистан на древнем кладбище Чокардиза над могилой известного учёного имама Абу Мансура Мухаммада аль-Мотуруди был возведён мавзолей, который венчает изящный ребристый купол. Имя этого учёного широко известно во всём мусульманском востоке как философа-теолога. Он родился в 870 году под Самаркандом в селении Мотруд (или Мотрид) и был известен как основатель суннитской философской школы - мотурудия. Из его многочисленных произведений до нас дошёл его главный труд «Китаб аль-Таухид» («Книга о единстве бога»), в которой он обосновал основные положения Ислама. Специалисты подчеркивают, что он сумел предвидеть и предотвратить распад Ислама на различные секты и течения. Он считал, что Ислам нужно толковать на основе разума, а не на слепом следовании религиозным авторитетам.

Имам аль-Мотуруди скончался в 945 году и был похоронен на священном кладбище Чокардиза («Чокар» - воин, «диза» - крепость), где издревле хоронили учёных, прославившихся воинов, богословов. Это кладбище как священное сравнивают с кладбищами Бокия в Медине и Муалло в Мекке. За мавзолеем аль-Мотурудий находится склеп – дахма самаркандских сейидов – потомков пророка Мухаммада. Так же здесь были похоронены знаменитый правовед Бурханиддин аль-Маргилани и др.

Саид Ахмад или Мавлоно Джалолиддин Ходжаги Косони (1461-1542 гг.), прозванный в народе Махдуми Аъзам («Великий господин») был философом, крупным религиозным и государственным деятелем, написавший более 30 произведений в области философии, теологии, этики, мусульманского права. Именно ему принадлежат слова «Не человек создан для религии, а религия для человека», - этим он призывал быть ответственным за мир и порядок в мире, активно содействовать процветанию страны. Многие правители Средней Азии, Афганистана, Индии и Ирана изучали его труды и считали его своим духовным наставником, а некоторые даже завещали похоронить себя после смерти рядом с ним. К северу от Самарканда, в селении Дахбед, который по легенде им же был основан, он похоронен в окружении своих близких, почитателей и учеников. Здесь имеются построенные в XVI и в XVII веках мечети, невысокий минарет, водоём – хауз и чинара – дерево которому более 500 лет. Легенда связывает это дерево с деятельностью этого учёного.

Слово Ишрат-хана переводится как «Дом радости, наслаждений». Это название, по мнению специалистов, возникло из-за неправильного произношения слова «Ашрат-хана», что переводится с арабского как «Десять комнат». Позже появилась легенда о том, что здание, строившееся как мавзолей, своей красотой восхитило самого Амира Темура, и он воскликнул «Пусть это будет Дом радости, а мавзолей построить в другом месте!». На самом деле Ишрат-хана была построена как мавзолей во второй половине XV века от имени жены темуридского правителя Абу-Саида Хабибы Султан-бегим для рано усопшей дочери Султан Ховенд-бика. Но постепенно просторный восьмигранный склеп мавзолея стал династийной усыпальницей с 23 женскими и детскими погребениями. Здание имело в центре высокий крестообразный в плане зал, с водружённым на него изящным куполом на стройном барабане, который не сохранился. По обе стороны на двух этажах располагались подсобные помещения и поминальная мечеть, из которой ведет ступенчатый спуск в склеп. Стройный высокий портал с двухъярусными лоджиями, украшен глазурованными кирпичами и вставками мозаичных картушей. В интерьере применена в обилии позолота с росписью.

Этот памятник является одним из шедевров темуридской архитектуры.

В южном пригороде Самарканда похоронен один из крупных религиозных и государственных деятелей XV-века Ходжа Ахрар Вали, глава ордена Накшбандия, игравший большую роль в политической и духовной жизни государства темуридов. Он являлся философом написавший много произведений философско-этического характера. Над его могилой, установлена беломраморная стела с эпитафией, вокруг похоронены его родные и многочисленные последователи – муриды, среди которых были даже правители Афганистана. Неподалёку, на старых фундаментах ХV века высится мечеть ХIХ века, с расписным айваном и михрабом ХVII века. В центре двора располагается водоём. Рядом с ним высится невысокий минарет, построенный зодчим Сагдуллой.

В годы независимости были заново возрождены многие архитектурные памятники и места почитания и поклонения верующих. Самым важным из таких мест является мемориальный комплекс Аль Бухари. Знаменитый учёный хадисовед (собиратель хадисов – изречений, установок и предписаний пророка Мухаммада) Имам Абу Абдулло Мухаммад ибн Исмаил Аль-Бухари, родившийся в Бухаре в 810 году, всю свою жизнь собирал и анализировал хадисы. За всю свою жизнь он собрал 600 тысяч хадисов, а в его главный труд – книгу «Ал-Джами ас-Сахих» («Собрание достоверных хадисов») вошли около 7300 достоверных хадисов, и она ещё в Х веке была объявлена второй после Корана священной книгой для мусульман. Долгие годы, прожив за границей, он вернулся на родину но правитель Бухары завидуя его славе дал ему понять, что его присутствие не желательно. Имам аль-Бухари переселился в селение Хартанг в 25 км от Самарканда, где в 870 году скончался и был похоронен. На месте его могилы был построен мавзолей, близ которого воздвигнута мечеть.

По решению правительства Узбекистана на этом месте в 1998 году, который был объявлен «годом Аль-Бухари», был возведён новый мемориальный комплекс, включающий в себя мавзолей, большую мечеть, музей и небольшой конференц-зал.